主管福建的黨內紀律檢查工作。負責貫徹落實中央和福建黨委關于加強黨風廉政建設的決定，認真抓好反腐敗斗爭，維護黨的章程和其他黨內法規，檢查黨的路線、方針、政策和決議的執行情況；
主管福建的行政監察工作。負責貫徹落實黨中央、國務院和福建黨委和政府有關行政監察工作的決定，監督檢查福建政府各部門及其工作人員和各市、地、州人民政府（行署）及其主要負責人執行國家政策和法律法規、國民經濟和社會發展計劃及福建政府頒發的決議和命令的情況。
負責檢查并處理福建黨委和政府機關各部門，各市、地、州黨組織和福建黨委管理的黨員領導干部違反黨的章程及其他黨內法規的案件，決定或取消對這些案件中的黨員的處分：受理黨員的控告和申訴，必要時直接查處下級黨的紀律檢查機關管轄范圍內的比較重要或復雜的案件。
負責調查處理福建政府各部門及其工作人員，各市、地、州政府（行署）及其主要負責人違反國家政策，法律，法規以及違反政紀的行為，并根據責任人所犯錯誤的悄節輕重，作出撤職及撤職以下的行政處分（對涉及選舉產生的領導干部按法定程序辦理）；受理監察對象不服政紀處分的申訴，受理個人或單位對監察對象違紀行為的檢舉、控告。